디지털헬스학과 입학생을 지도할 수 있는 교수진 명단은 아래와 같습니다. 입학 지원시 해당 교수의 프로필 및 연구분야를 반드시 확인하시기 바랍니다.
| 연구실 교수 / |
이름 : 연구실
소속 :
직급 :
캠퍼스 :
연구실 : 정밀면역치료를 위한 암유전체 연구실/이세훈 교수 E-mail : shlee119@skku.edu Homepage : 실험실명 : 참여학과 : 융합의과학과, 디지털헬스학과 인쇄하기 |
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■ 연구실 소개
본 연구실은 폐암에서 면역치료(Immunotherapy)에 대한 연구를 진행하고 있습니다. 실제 면역치료를 받은 폐암 환자의 임상정보와 유전체 정보를 이용하여 다양한 기초-임상 중개연구를 수행하고 있습니다. 궁극적으로는 암 중개연구(Translational Oncology)를 통해 환자에게 직접적으로 도움이 되는 치료전략을 개발하는 이른바 from bench to bedside를 실현하고자 합니다. 폐암 환자의 치료 전과 후의 인체유래물 (혈액, 조직, 흉수 등)로부터 DNA및 RNA를 분리하여 차세대염기서열분석(Next generation sequencing, NGS) 기반으로 유전체 또는 전사체를 분석합니다. 이를 통해 유전적 변이나 유전자 발현 정도의 차이를 파악함으로써 폐암의 발생 및 진행 기전을 이해하고, 조기 진단 및 예후 예측을 위한 바이오마커를 발굴하며, 환자 특이적인 치료 약물 반응성을 이해하는 등의 연구를 수행하고 있습니다. 또한 임상-유전체 데이터 기반으로 다양한 알고리즘을 개발하여 암신생항원(Neoantigen)을 발굴하고 저항성을 계산함으로써 면역항암제에 대한 치료 반응성을 예측하여 Personalized medicine 실현을 위해 노력하고 있습니다. 현재, 환자 임상정보와 더불어 2000례 이상의 유전체 분석 데이터(whole exome sequencing 및 whole exome sequencing 등)를 보유 중이며 클라우드 컴퓨팅 기반 기술을 적용하여 공공 데이터베이스 시스템을 구축하였고, 이를 기반으로 MSKCC, Crick Institute, Johns Hopkins university 등의 해외 선도 그룹 및 KAIST, UNIST, SNU, LUNIT 등의 국내 유수 대학, 기업들과 공동연구를 진행하고 있습니다. 종양미세환경(Tumor microenvironment)이 치료 반응성에 매우 중요한 영향을 미치는 것으로 예측되는 바, 종양미세환경을 이해하기 위해 다양한 각도의 연구가 진행중입니다. 종양세포(tumor cell) 뿐만 아니라 정상세포(normal cell), 기질세포(stromal cell), 혈관세포(endothelial cell), 특히 다양한 면역세포(immune cell)들이 복잡한 네트워크를 형성하고 있기 때문에 이들의 종류, 분포 및 상호작용을 파악하기 위해 단일세포 수준에서 이들 각각의 전사체 분석을 수행하고 있으며 (single cell RNA sequencing), 조직 전체가 아닌 세포 수준의 유전자 발현 변화에 따른 면역치료 반응성을 연구하고 있습니다. 면역항암 환자에서는 면역세포의 활성화(activation), 침투(infiltration), 기능저하성 탈진 (dysfunctional exhaustion) 등이 면역치료제 반응성 및 환자의 예후와 밀접한 상관관계가 있기 때문에 flow cytometry, ELISpot, ELISA, multiplex IHC 등 다양한 면역학적인 실험 방법을 더하여 이를 파악하고자 합니다. 그 밖에, 환자유래 암세포 (patient-derived cell) 및 3차원 오가노이드(organoid), 세포주(cell line) 배양에서 약물반응성(high throughput drug test)을 확인하고 관련 기전을 이해하기 위한 다양한 functional study를 수행하고 있습니다. 그리고, 장내 미생물 microbiome 이해를 통한 면역항암 치료제 반응성 연구, 액체 생검을 통한 cell-free DNA 연구 등 다양한 흥미로운 연구들을 진행하기 위해 여러 가지 민간, 원내, 국책과제를 수행 중에 있습니다. 더불어, 본 연구실의 연구책임자는 기초연구 지원센터장으로 기초연구 활성화를 위한 실험 기법 및 교육 지원을 진행하고 있으며, 기초연구에 전반적인 자문 서비스를 지원하고 있습니다. 현재 기초연구 지원센터에서 실습 및 교육하고 있는 기법으로는 세포배양 기법, 분자-세포생물학 기초 실험기법(PCR, Western blot, ELISA 등)을 교육하며, 이미지 분석(Confocal microscope, Fluorescence microscope, Slide scanner 등), 유세포 분석(Flow cytometry), 분광/입자 분석(Plate reader, ELISpot reader 등), 유전자/세포활성 분석(qRT-PCR, Bioanalyzer, Extracellular flux analyzer 등)을 할 수 있는 공동 기기를 이용한 실험 기법의 실습 및 교육 지원을 진행하고 있습니다. ■ 연구실 연락처 shlee119@skku.edu |